青色申告決算書を財務から取り込みましたが、昨年の内容が連動されます。

青色申告決算書を財務から取り込みましたが、連動されてきた内容が昨年のものでした。

財務側で青色申告決算書を（今年になってから）一度も起動していないためです。
財務R4では、繰越処理をしても青色申告決算書内のデータは昨年のデータをそのまま保持しています。
仕訳等を入力しても自動反映はされないため、所得税に連動する前に財務側で青色申告決算書を開いていただく必要があります。