伝票集計で業種ごとに青色申告決算書を作成することはできません。

一般と不動産で別の会社データを作成して伝票集計するか、
または、一般と不動産を部門として設定し、部門別試算表を作成して業種ごとに上書き入力で青色申告決算書を作成してください。