電子申告R4で、税理士データを選択後、［01.納税者基本情報］タブの［電子証明書の登録・変更］を行います。
（国税、地方税それぞれに対し、行う必要があります。）

電子証明書の登録を行うと、国税、地方税ともに、受付結果が届きます。
メッセージ一覧画面から［受信(F2)］の操作を行うことで受付結果を受信することができます。
・国税　：「件名：電子証明書の登録」
・地方税：「件名：利用届出・証明書差替」